Казанская церковь в духе сибирского барокко была построена в 1776-1789 годы при помощи купца Шевырина. Четверик, увенчанный мелким пятиглавием, с двухпридельной трапезной. Колокольня выстроена в 1860 году.
Домовая церковь Трех Святителей в новопостроенном келейном корпусе монастыря. Корпус с элементами византийского стиля в декоре, храм внешне выделен куполом.
Однокупольная кирпичная часовня Феодора Томского в духе эклектики. Первая часовня была выстроена над могилой праведного старца Феодора Томского (старца Федора Кузьмича) в 1904 году, сломана в середине ХХ в. В 1995 после раскопок обретены мощи св. Феодора, в 1996-1997 на старом месте по образцу прежней выстроена новая часовня.